29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1228 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1228  surface antigen (D15)  100 
 
 
753 aa  1502    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0487  surface antigen (D15)  26.71 
 
 
711 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00051966  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0472  surface antigen (D15)  26.42 
 
 
711 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000471704  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0916  surface antigen  26.78 
 
 
727 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.733535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0806  surface antigen (D15)  25.13 
 
 
737 aa  147  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  23.85 
 
 
553 aa  81.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  21.25 
 
 
683 aa  65.1  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  20.9 
 
 
808 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  20.93 
 
 
763 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  20.86 
 
 
778 aa  57  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  21.52 
 
 
888 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  20.96 
 
 
896 aa  54.7  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  24.71 
 
 
560 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.15 
 
 
802 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  21.49 
 
 
752 aa  52.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  24 
 
 
767 aa  52.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  22.08 
 
 
785 aa  51.2  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  19.97 
 
 
895 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  23.23 
 
 
807 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  23.04 
 
 
688 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  23.5 
 
 
803 aa  48.9  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.25 
 
 
772 aa  48.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  26.24 
 
 
762 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1808  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.72 
 
 
868 aa  48.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  22.13 
 
 
818 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.56 
 
 
793 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.56 
 
 
793 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  21.56 
 
 
769 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  20.4 
 
 
767 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>