35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2992 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2992  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  463  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  hitchhiker  0.00544099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0028  hypothetical protein  37.28 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0206923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0046  hypothetical protein  34.35 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1150  BioH protein, putative  35.87 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256241 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3005  BioH protein, putative  33.64 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773355 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2540  BioH protein, putative  31.22 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0320  BioH protein, putative  33.83 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0331  BioH protein, putative  33.17 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0342  BioH protein, putative  33.33 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  29.32 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  28.06 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 346 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  28.92 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  28.92 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26790  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  21.79 
 
 		 290 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.330263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  31.52 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  25.83 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  25.83 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  25.83 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 328 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  30.4 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 		 275 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0879  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 290 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0890  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 290 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0873  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 290 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  24.03 
 
 		 302 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>