19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2540 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2540  BioH protein, putative  100 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1150  BioH protein, putative  34.58 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0046  hypothetical protein  33.78 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0028  hypothetical protein  32.29 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0206923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0331  BioH protein, putative  33.48 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0342  BioH protein, putative  33.48 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3005  BioH protein, putative  32.55 
 
 		 233 aa  93.6  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00773355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0320  BioH protein, putative  33.33 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2992  hypothetical protein  31.22 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  hitchhiker  0.00544099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2080  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2124  alpha/beta hydrolase fold protein  27.23 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 		 265 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  26.73 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0093  alpha/beta fold family hydrolase  25.46 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  24.14 
 
 		 303 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  34.65 
 
 		 256 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>