29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1811 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  330  9e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  83.59 
 
 		 195 aa  329  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  82.56 
 
 		 195 aa  327  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  79.49 
 
 		 195 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  80 
 
 		 195 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  80 
 
 		 195 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  80 
 
 		 195 aa  310  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  80 
 
 		 195 aa  295  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  80 
 
 		 195 aa  291  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  85.49 
 
 		 195 aa  277  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  43.24 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  42.31 
 
 		 236 aa  137  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  35.43 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  34.86 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  34.55 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  30 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  28.9 
 
 		 432 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  27.72 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  30.36 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  32.17 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  25.95 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0788  yecA family protein  30.22 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  30 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  27.47 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1273  yecA family protein  28.66 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  27.16 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  26.78 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  25.95 
 
 		 225 aa  41.2  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>