16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0933 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0933  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1141  hypothetical protein  52.65 
 
 
272 aa  263  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1434  hypothetical protein  41.92 
 
 
273 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3620  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 
268 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2252  hypothetical protein  31.53 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.303114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2749  hypothetical protein  27.48 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.594508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6234  hypothetical protein  25.23 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170418  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0875  hypothetical protein  30.39 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.978348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0585  hypothetical protein  31.45 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0670  hypothetical protein  32.19 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94311  predicted protein  25.87 
 
 
406 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0870  hypothetical protein  24.68 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.706129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
827 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 
226 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0434  hypothetical protein  28.47 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
3145 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>