33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0648 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0648  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  270  7e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  59.29 
 
 
117 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0790  protein of unknown function DUF891  58.04 
 
 
117 aa  142  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0649  hypothetical protein  58.04 
 
 
117 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1910  hypothetical protein  64.18 
 
 
101 aa  92  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1360  protein of unknown function DUF891  41.96 
 
 
119 aa  90.5  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.654316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2426  hypothetical protein  40.82 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.79489  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  40 
 
 
117 aa  83.6  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0353  hypothetical protein  36.11 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2965  hypothetical protein  37.93 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4024  protein of unknown function DUF891  34.23 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0606  hypothetical protein  34.65 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.921566  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0589  hypothetical protein  77.42 
 
 
62 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4453  protein of unknown function DUF891  34.26 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280923  normal  0.143074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3973  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.728273  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  33.96 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0155  protein of unknown function DUF891  30.77 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1587  protein of unknown function DUF891  43.1 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7033  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00542109  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0294  protein of unknown function DUF891  29.91 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  30.1 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  39.39 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3492  protein of unknown function DUF891  30.36 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.603175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1385  hypothetical protein  52.17 
 
 
68 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1855  hypothetical protein  26.89 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157917 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0011  prophage protein gp49  43.14 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.25604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4176  hypothetical protein  26.02 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4191  hypothetical protein  26.02 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0913  hypothetical protein  34.38 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1917  hypothetical protein  41.1 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000207815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3410  hypothetical protein  30.43 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4581  protein of unknown function DUF891  40.98 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.767323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3341  hypothetical protein  24.39 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>