17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0624 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0624  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  173  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2153  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0764  putative transmembrane anti-sigma factor  57.83 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0758  putative transmembrane anti-sigma factor  59.15 
 
 		 78 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.163321 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0867  putative transmembrane anti-sigma factor  60.81 
 
 		 77 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.71952  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1890  hypothetical protein  54.93 
 
 		 78 aa  87  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1703  putative transmembrane anti-sigma factor  58.57 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.864451  hitchhiker  0.000407329 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2126  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 356 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0131  putative transmembrane anti-sigma factor  30.56 
 
 		 347 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000144677  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0910  putative transmembrane anti-sigma factor  33.82 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0600  hypothetical protein  33.85 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2363  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.88 
 
 		 376 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.824355  hitchhiker  0.000839626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1785  putative transmembrane anti-sigma factor  32.35 
 
 		 311 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1097  normal  0.379746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1784  putative transmembrane anti-sigma factor  33.33 
 
 		 300 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3767  anti-sigma factor  36.36 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.544196  normal  0.304611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2457  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  30.88 
 
 		 320 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.339565  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2285  putative transmembrane anti-sigma factor  34.62 
 
 		 360 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000826117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>