34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2782 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2782  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 1625 aa  3266    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.734517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2630  Pyrrolo-quinoline quinone  25.37 
 
 		 1645 aa  150  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2341  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1513 aa  113  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0224053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3852  Pyrrolo-quinoline quinone  22.73 
 
 		 1630 aa  75.5  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.45 
 
 		 1812 aa  53.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.83 
 
 		 393 aa  51.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  22.71 
 
 		 371 aa  49.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 393 aa  48.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0685  hypothetical protein  28.48 
 
 		 387 aa  48.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000893693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 458 aa  48.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.38 
 
 		 393 aa  48.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.97 
 
 		 393 aa  47.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 643 aa  47.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 		 383 aa  47.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.84 
 
 		 393 aa  47  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 381 aa  46.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  20.93 
 
 		 616 aa  46.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 774 aa  45.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0655  Pyrrolo-quinoline quinone  27.81 
 
 		 402 aa  45.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.808652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.35 
 
 		 411 aa  45.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  26.16 
 
 		 484 aa  45.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  26.64 
 
 		 392 aa  45.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>