More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1474 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1474  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
527 aa  1079    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.242191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2504  aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
523 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0589644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01440  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  51.24 
 
 
538 aa  430  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.298028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  42.32 
 
 
525 aa  336  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  41.36 
 
 
525 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 
525 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  40.45 
 
 
525 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  40.26 
 
 
525 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
525 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  40.08 
 
 
525 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 
525 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 
525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  39.7 
 
 
525 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
526 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 
533 aa  313  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  38.72 
 
 
527 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  38.16 
 
 
527 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
532 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
530 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  41.1 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  39.58 
 
 
527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  38.45 
 
 
530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5585  Aldehyde Dehydrogenase  41.43 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.553725  normal  0.902956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  38.27 
 
 
537 aa  303  6.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
527 aa  300  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
525 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  38.12 
 
 
536 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  37.35 
 
 
489 aa  295  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
527 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
529 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  40.39 
 
 
523 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  40.39 
 
 
523 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5169  aldehyde dehydrogenase  37.66 
 
 
530 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0593368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 
525 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
525 aa  292  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
530 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
530 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
525 aa  291  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
526 aa  291  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  37.36 
 
 
524 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  38.82 
 
 
527 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  37.16 
 
 
526 aa  289  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  37.83 
 
 
526 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  36.24 
 
 
525 aa  289  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  37.83 
 
 
526 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 
526 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  38.04 
 
 
656 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  38.04 
 
 
656 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  38.04 
 
 
659 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
530 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  38.03 
 
 
530 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  37.64 
 
 
526 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  40.17 
 
 
536 aa  286  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  39.81 
 
 
527 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  37.22 
 
 
527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
525 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
525 aa  283  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  35.47 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  38.34 
 
 
530 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  38.88 
 
 
524 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 
530 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
512 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
526 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  39.57 
 
 
528 aa  280  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
527 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  38.33 
 
 
530 aa  279  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
527 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  37.57 
 
 
526 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1484  aldehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
497 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  37.69 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  37.69 
 
 
526 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
538 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
507 aa  273  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 
524 aa  273  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
526 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  38.27 
 
 
533 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  38.8 
 
 
530 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  36.99 
 
 
526 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1760  aldehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
521 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000916491  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  37.57 
 
 
526 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  37.93 
 
 
526 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  38.77 
 
 
530 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  38.77 
 
 
530 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  38.77 
 
 
530 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  37.3 
 
 
505 aa  267  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  38.77 
 
 
530 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.77 
 
 
530 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  38.77 
 
 
530 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
526 aa  265  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
527 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  35.19 
 
 
510 aa  260  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1631  aldehyde dehydrogenase family protein  39.33 
 
 
536 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.464757  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  38.45 
 
 
549 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  36.22 
 
 
504 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  36.19 
 
 
537 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
522 aa  257  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  38 
 
 
508 aa  256  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>