More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2665 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 468 aa  959    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  60.52 
 
 		 459 aa  545  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 458 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 472 aa  521  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  58.24 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 		 474 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  55.99 
 
 		 459 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 449 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  54.7 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  52.06 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0149  cysteinyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 449 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 459 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 481 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 490 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 459 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 460 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 459 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 461 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 461 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 459 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 459 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 458 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 459 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1888  cysteinyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.298729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 500 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 466 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 465 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 482 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 460 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 460 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  49.46 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>