28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_2003 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_2003  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  619  1e-176  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1048  hypothetical protein  86.38 
 
 
306 aa  503  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.82429  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2160  hypothetical protein  75.08 
 
 
318 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0226  hypothetical protein  69.97 
 
 
306 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0625321 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1724  hypothetical protein  48.73 
 
 
322 aa  264  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0020  conserved hypothetical protein  34.15 
 
 
290 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0033  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  30.57 
 
 
495 aa  59.7  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0030  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.13 
 
 
494 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00267485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1072  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.7 
 
 
494 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0024  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  24 
 
 
522 aa  56.6  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2160  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26 
 
 
500 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0308636  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2149  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.64 
 
 
495 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4036  hypothetical protein  30.5 
 
 
200 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230757 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1536  tRNA-guanine transglycosylase  25.94 
 
 
507 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000216588 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2181  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.48 
 
 
489 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3185  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  22.87 
 
 
344 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0941  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.42 
 
 
483 aa  51.2  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.4752  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1660  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.79 
 
 
476 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1434  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  25.87 
 
 
489 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.87603  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  24.55 
 
 
606 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1088  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.3 
 
 
490 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.27 
 
 
652 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1207  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  23.49 
 
 
481 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.40758  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2272  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  27.27 
 
 
498 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.512273  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0356  tRNA-guanine transglycosylases, various specificities  26.13 
 
 
543 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1313  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  21.75 
 
 
482 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.258751 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1120  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  24.58 
 
 
489 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0719  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  23.91 
 
 
491 aa  42.4  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>