26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2563 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2563  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  803    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3756  hypothetical protein  34.93 
 
 		 361 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4761  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.12 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00629  hypothetical protein  33.48 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11606  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6151  hypothetical protein  31.98 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361634  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1959  hypothetical protein  25.65 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3012  hypothetical protein  26.8 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  30.35 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1048  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.45 
 
 		 363 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3223  UvrD/REP helicase  19.73 
 
 		 591 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0002  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 627 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00501949  unclonable  0.0000000152261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  21.17 
 
 		 1027 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  19.94 
 
 		 1060 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 666 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5077  UvrD/REP helicase  23.74 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935976  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2692  DNA helicase IV  20.8 
 
 		 685 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  20.45 
 
 		 1059 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  23.64 
 
 		 768 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 662 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 946 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 946 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.05 
 
 		 1089 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0653  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  32.73 
 
 		 1169 aa  43.9  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0230534  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  27.37 
 
 		 723 aa  43.1  0.008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  36.67 
 
 		 870 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 		 659 aa  43.1  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>