38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2044 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2044  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  194  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218821  normal  0.592875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2780  hypothetical protein  45.83 
 
 		 336 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000960474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1856  hypothetical protein  32.26 
 
 		 370 aa  51.2  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0333  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50 
 
 		 325 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0672756 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3074  CheW protein  50 
 
 		 325 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464984  normal  0.367409 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0111  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3465  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0641119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0562  hypothetical protein  45.83 
 
 		 370 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0862774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0281  hypothetical protein  47.62 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1436  protein of unknown function DUF1568  40.82 
 
 		 341 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0607  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0282  hypothetical protein  50 
 
 		 325 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822944  hitchhiker  0.00000243422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2324  Elongator protein 3/MiaB/NifB  50 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0123865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2943  histidine kinase  47.62 
 
 		 325 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01831  hypothetical protein  50 
 
 		 271 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2906  hypothetical protein  45.24 
 
 		 329 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02306  hypothetical protein  44.9 
 
 		 324 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3017  hypothetical protein  38.1 
 
 		 325 aa  43.5  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0296678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2840  protein of unknown function DUF1568  45.95 
 
 		 345 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0644633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0856  hypothetical protein  30.77 
 
 		 347 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2933  hypothetical protein  29.87 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.161086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1700  protein of unknown function DUF1568  41.67 
 
 		 377 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0868  hypothetical protein  43.24 
 
 		 344 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3659  hypothetical protein  43.24 
 
 		 347 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1697  hypothetical protein  43.24 
 
 		 349 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2414  hypothetical protein  43.24 
 
 		 341 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.301389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2403  hypothetical protein  43.24 
 
 		 341 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.284659  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3299  hypothetical protein  27.85 
 
 		 213 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3200  hypothetical protein  43.24 
 
 		 344 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.789239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1226  protein of unknown function DUF1568  44.12 
 
 		 341 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.353731  hitchhiker  0.000000017845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2480  hypothetical protein  43.24 
 
 		 344 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  32.79 
 
 		 323 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1542  hypothetical protein  36.73 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1178  hypothetical protein  40.54 
 
 		 344 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal  0.0825627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1126  hypothetical protein  40.54 
 
 		 344 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3323  hypothetical protein  37.84 
 
 		 325 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2679  hypothetical protein  39.58 
 
 		 336 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0910  hypothetical protein  40.54 
 
 		 344 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>