20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0647 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0647  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3089  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.591077  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3171  tripartite ATP-independent periplasmic (TRAP) C4-dicarboxylate transporter subunit DctQ  39.32 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1339  TRAP dicarboxylate transporter, DctQ subunit, putative  37.3 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1304  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  38.57 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.678951  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3744  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  31.25 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.374657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1732  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  22.52 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00171017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2056  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  33.33 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1481  hypothetical protein  26.32 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0572802  normal  0.376105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0860  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  30.26 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.346513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3296  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  28.69 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.165555  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0023  permease (transport protein)  26.87 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.352968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0755  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  33.9 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3572  hypothetical protein  34.78 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.163728 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1707  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  25.98 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0662  hypothetical protein  27.72 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00108273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000630  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system small permease component  23.02 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3213  tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ  29.81 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2215  tripartite ATP-independent periplasmic transporters, DctQ component, putative  30 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0131371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>