More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2862 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2862  Glycine C-acetyltransferase  100 
 
 
427 aa  897    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  39.3 
 
 
416 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.95 
 
 
395 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  39 
 
 
393 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  38.33 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  38.33 
 
 
391 aa  254  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  35.12 
 
 
401 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  39.37 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
395 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.67 
 
 
395 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  39.19 
 
 
395 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  35.28 
 
 
401 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  36.58 
 
 
396 aa  245  9e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.75 
 
 
395 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.97 
 
 
391 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 
428 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.86 
 
 
400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.25 
 
 
395 aa  239  8e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.97 
 
 
391 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.58 
 
 
396 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.47 
 
 
396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.81 
 
 
404 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.26 
 
 
400 aa  233  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.07 
 
 
396 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2203  8-amino-7-oxononanoate synthase  36 
 
 
400 aa  231  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.07 
 
 
396 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.83 
 
 
396 aa  230  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  37.43 
 
 
395 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.41 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  36.78 
 
 
393 aa  226  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2152  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.41 
 
 
404 aa  226  7e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00977448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.14 
 
 
400 aa  226  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.25 
 
 
389 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  34.72 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.77 
 
 
397 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.28 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.54 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0057  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.12 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0731  Glycine C-acetyltransferase  36.24 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000138233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.75 
 
 
389 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_002950  PG0481  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.5 
 
 
396 aa  216  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.91 
 
 
397 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0698  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.68 
 
 
397 aa  216  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.84 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  33.43 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4145  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.48 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0071  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.48 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.48 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.24 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4407  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.34 
 
 
395 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  33.15 
 
 
395 aa  212  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.17 
 
 
397 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2930  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.1 
 
 
397 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.573934  normal  0.531158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.27 
 
 
394 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.43 
 
 
384 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.55 
 
 
397 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2100  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.99 
 
 
386 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4686  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.01 
 
 
396 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4366  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.62 
 
 
400 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000326291  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.3 
 
 
397 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0065  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.33 
 
 
381 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00162329  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1996  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.73 
 
 
396 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.112082  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3938  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.61 
 
 
397 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.542648  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0200  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.73 
 
 
396 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.34 
 
 
395 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0537628  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3615  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.96 
 
 
397 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.011325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  31.54 
 
 
424 aa  207  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4824  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.2 
 
 
398 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0495  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.61 
 
 
396 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.08 
 
 
401 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2618  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.71 
 
 
441 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3011  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  35.71 
 
 
441 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  33.05 
 
 
390 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  33.24 
 
 
390 aa  206  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  33.05 
 
 
390 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06510  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.08 
 
 
401 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.51 
 
 
397 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.51 
 
 
397 aa  206  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4329  Aminotransferase protein  36.47 
 
 
455 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.617372  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  33.24 
 
 
390 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.24 
 
 
390 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  33.24 
 
 
390 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.47 
 
 
391 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5175  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.93 
 
 
392 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701145  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0226  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.43 
 
 
401 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3945  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.76 
 
 
398 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
398 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0067  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.77 
 
 
381 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.12 
 
 
400 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.13 
 
 
390 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.04 
 
 
395 aa  202  7e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.23 
 
 
397 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>