46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5570 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5001  hypothetical protein  84.2 
 
 		 815 aa  1404    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5448  hypothetical protein  82.67 
 
 		 808 aa  1337    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5570  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7560  hypothetical protein  77.68 
 
 		 811 aa  1244    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125475  normal  0.437403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  28.15 
 
 		 956 aa  72  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.27 
 
 		 975 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.63 
 
 		 971 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.95 
 
 		 1240 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  29.89 
 
 		 359 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.09 
 
 		 971 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.45 
 
 		 959 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  27.63 
 
 		 963 aa  57.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  29.32 
 
 		 788 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.05 
 
 		 1097 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  27.03 
 
 		 275 aa  55.1  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  26.47 
 
 		 315 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  26.47 
 
 		 315 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  28.63 
 
 		 791 aa  52  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 287 aa  50.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  27.76 
 
 		 238 aa  50.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  26.7 
 
 		 785 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  27.65 
 
 		 837 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  25.48 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.85 
 
 		 891 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.32 
 
 		 797 aa  48.9  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  22.73 
 
 		 757 aa  48.5  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.82 
 
 		 811 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  27.48 
 
 		 760 aa  48.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  25.66 
 
 		 788 aa  47.8  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  23.32 
 
 		 284 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  25.1 
 
 		 462 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 		 782 aa  47.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.67 
 
 		 867 aa  45.8  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.23 
 
 		 301 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  25.37 
 
 		 826 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.45 
 
 		 810 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 291 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 291 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 		 309 aa  44.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 291 aa  45.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 350 aa  44.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 308 aa  44.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 290 aa  44.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  22.61 
 
 		 456 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  24.39 
 
 		 761 aa  44.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>