21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4923 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  100 
 
 		 976 aa  1991    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  30.12 
 
 		 978 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  28.96 
 
 		 997 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.42 
 
 		 706 aa  79  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  22.94 
 
 		 736 aa  74.7  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  21.96 
 
 		 706 aa  62  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  22.18 
 
 		 749 aa  60.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  26.1 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  21.43 
 
 		 728 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  21.99 
 
 		 315 aa  56.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  23.72 
 
 		 564 aa  55.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  24.15 
 
 		 672 aa  53.5  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1063  KAP P-loop domain-containing protein  22.58 
 
 		 467 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  21.82 
 
 		 463 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  21.82 
 
 		 463 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  20.48 
 
 		 884 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  21.08 
 
 		 758 aa  50.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  18.22 
 
 		 735 aa  46.2  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  24.44 
 
 		 419 aa  45.8  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3526  KAP P-loop  23.7 
 
 		 580 aa  44.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  27.91 
 
 		 591 aa  44.7  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>