21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4068 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4068  hypothetical protein  100 
 
 		 678 aa  1401    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720614  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0435  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 241 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252383  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2092  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.80059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0365  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 197 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  30.3 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2180  hypothetical protein  33.98 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.810913  hitchhiker  0.000154627 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0954  hypothetical protein  25.62 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0087  glycosyl transferase  31.68 
 
 		 712 aa  57  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2761  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 278 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19348  hitchhiker  0.00634675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0357  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 194 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.305357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 596 aa  50.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3799  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 204 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4047  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440642  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4962  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 222 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 1739 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6325  hypothetical protein  26.51 
 
 		 403 aa  45.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2566  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 281 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3038  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 643 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236938  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2186  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 254 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0634  methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 198 aa  43.9  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839986  normal  0.828808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>