31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3943 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  65.5 
 
 		 266 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  67.21 
 
 		 252 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  65.12 
 
 		 266 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  67.39 
 
 		 266 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  64.32 
 
 		 279 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  56.98 
 
 		 279 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  60.34 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  47.62 
 
 		 261 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  35.69 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  36.96 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  36.44 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  35.83 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.95 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  36.4 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  36.4 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  36.4 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  35.96 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4554  hypothetical protein  36.25 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1150  hypothetical protein  29.71 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4130  histidine kinase  23.75 
 
 		 572 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.964997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3738  sensor histidine kinase/response regulator  28.19 
 
 		 917 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.466672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  25.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  25.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0369  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  22.58 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 243 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.11 
 
 		 243 aa  42  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>