12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3867 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3867  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2100  hypothetical protein  60.34 
 
 		 174 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.602321  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1895  hypothetical protein  55.83 
 
 		 174 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.609081  normal  0.30639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2147  hypothetical protein  58.99 
 
 		 190 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.367582  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3595  hypothetical protein  58.43 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1664  hypothetical protein  56.61 
 
 		 190 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.586195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1688  hypothetical protein  56.38 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374409  normal  0.176627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14560  hypothetical protein  49.36 
 
 		 174 aa  164  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25220  hypothetical protein  48.95 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2156  hypothetical protein  48.42 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1592  hypothetical protein  40.99 
 
 		 173 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.722973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  25.33 
 
 		 344 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>