18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0476 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  71.24 
 
 		 478 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  70.39 
 
 		 469 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  100 
 
 		 485 aa  988    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  69.46 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  69.25 
 
 		 467 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  66.02 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  69.74 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  68.82 
 
 		 467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  67.17 
 
 		 473 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  60.39 
 
 		 487 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  60.85 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0845  LmbE family protein  29.21 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1264  LmbE-like protein protein  34.08 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1028  LmbE family protein  30.05 
 
 		 300 aa  52.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.912842  normal  0.457472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0814  LmbE family protein  28.28 
 
 		 316 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  25.3 
 
 		 693 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4142  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  21 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.513919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2021  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  21.36 
 
 		 647 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>