25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1622 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1622  protein of unknown function DUF1525  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0432  protein of unknown function DUF1525  82.52 
 
 
152 aa  218  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1395  hypothetical protein  63.5 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1253  hypothetical protein  63.5 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4182  hypothetical protein  61.31 
 
 
148 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0554824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3427  hypothetical protein  62.88 
 
 
148 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.499762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1181  hypothetical protein  56.85 
 
 
148 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2356  hypothetical protein  67.59 
 
 
148 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000738169  unclonable  0.000000124616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0686  protein of unknown function DUF1525  70.09 
 
 
148 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.576261  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2183  hypothetical protein  66.39 
 
 
149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2397  hypothetical protein  67.23 
 
 
149 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0945  protein of unknown function DUF1525  64.17 
 
 
149 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2862  protein of unknown function DUF1525  64.96 
 
 
120 aa  133  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0491  hypothetical protein  44.44 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59980  hypothetical protein  45.3 
 
 
143 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.840796  hitchhiker  0.00000000548073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0850  hypothetical protein  42.74 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1430  hypothetical protein  42.06 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36340  hypothetical protein  48.67 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3702  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4075  hypothetical protein  38.68 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0348  hypothetical protein  37.7 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4165  hypothetical protein  37.17 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0678  protein of unknown function DUF1525  33.33 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1776  hypothetical protein  30.56 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0650  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>