65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0319 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
95 aa  194  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  74.47 
 
 
94 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  74.47 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  73.4 
 
 
94 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  65.52 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  61.7 
 
 
96 aa  123  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  62.37 
 
 
93 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.37 
 
 
93 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  60.64 
 
 
95 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  61.29 
 
 
96 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  60.64 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  62.37 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  63.22 
 
 
94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  57.47 
 
 
93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  60.22 
 
 
96 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  59.14 
 
 
96 aa  110  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  56.32 
 
 
93 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  59.14 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  58.06 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  59.14 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  59.14 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  56.99 
 
 
96 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  53.76 
 
 
103 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  61.29 
 
 
96 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  60.22 
 
 
93 aa  106  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  56.99 
 
 
94 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  56.99 
 
 
94 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.99 
 
 
94 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.99 
 
 
94 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  55.91 
 
 
94 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  59.14 
 
 
94 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  57.47 
 
 
95 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  54.74 
 
 
95 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  53.41 
 
 
95 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.87 
 
 
95 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  60.22 
 
 
94 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  59.14 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  61.43 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  57.53 
 
 
85 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  58.06 
 
 
94 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.49 
 
 
106 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  52.69 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  59.09 
 
 
72 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  59.09 
 
 
72 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  51.22 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.3 
 
 
114 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  54.84 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  44.57 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  53.76 
 
 
95 aa  74.7  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  52.87 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  49.25 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  62.22 
 
 
49 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  64.29 
 
 
49 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  54.55 
 
 
50 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3196  plasmid stabilization system protein  32.14 
 
 
89 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0380  RelE/StbE family addiction module toxin  34.12 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  65.71 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3715  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.49 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  30.12 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4227  hypothetical protein  62.86 
 
 
35 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4263  hypothetical protein  62.86 
 
 
35 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3569  addiction module toxin, RelE/StbE  30.95 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000172224  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7033  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.66 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.705501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>