92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3240 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3240  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3220  hypothetical protein  63.41 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.46717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  69.07 
 
 		 358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1741  esterase/lipase-like protein  44.03 
 
 		 631 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0611967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  28.74 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  27.13 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  28.57 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  24.89 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  27.56 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  27.39 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  26.24 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  24 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  24.27 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  28.63 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  21.85 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  28.19 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  27.75 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  28.02 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  27.92 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  27.43 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  28.64 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  27.89 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  29.03 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  27.36 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  25.23 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  29.09 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  28.9 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  27.03 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  27.69 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  25.74 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  21.89 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  27.54 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  24.55 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  26.81 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  25.39 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  28.04 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  27.71 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  22.37 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  28.84 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  26.03 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  26.07 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  28.44 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  30.48 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  26.36 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  26.29 
 
 		 258 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  24.34 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  24.88 
 
 		 337 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  26.36 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  27.24 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  25.82 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  25.96 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  23.9 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  25 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  24.44 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  20.78 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1049  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.76 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.991492 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  24.09 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1326  phospholipase/carboxylesterase  33.62 
 
 		 222 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  26.43 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0221  lipase/esterase  26.9 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3795  esterase/lipase  25.33 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.662401  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2657  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.81 
 
 		 426 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  23.22 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3874  hypothetical protein  24.57 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.03 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  24.64 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  39.58 
 
 		 652 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4875  putative lipase/esterase  23.17 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  27.07 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  22.89 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.03 
 
 		 417 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  26.03 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2729  alpha/beta hydrolase family protein  27.08 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  26.03 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.03 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.94 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3429  hypothetical protein  46 
 
 		 178 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.85 
 
 		 642 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1189  phospholipase/Carboxylesterase  31.37 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  28.26 
 
 		 643 aa  43.9  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  30.72 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  29.51 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0640  Alpha/beta hydrolase  24.54 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.225482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2030  Esterase/lipase-like protein  28.3 
 
 		 593 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2585  alpha/beta hydrolase family protein  27.08 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1003  carboxylesterase family protein  27.08 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  24.55 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00397  carboxylesterase  26.46 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  40 
 
 		 644 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>