More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2393 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2393  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  917    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3252  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.72 
 
 		 463 aa  548  1e-155  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.423075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1732  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.54 
 
 		 476 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0346367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2107  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.2 
 
 		 476 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0221886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3946  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.38 
 
 		 472 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2396  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.81 
 
 		 478 aa  516  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2349  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.14 
 
 		 476 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911217  normal  0.05196 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0111  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.45 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0293528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0101  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.45 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4233  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.45 
 
 		 470 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.98 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.17 
 
 		 490 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  48.37 
 
 		 483 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.81 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.44 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.11 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  46.84 
 
 		 482 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.63 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0443  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.44 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.47 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.21 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.68 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.68 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.68 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.68 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.68 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.07 
 
 		 477 aa  395  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2449  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.16 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.68 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07950  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.75 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.367535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2069  6-phosphogluconate dehydrogenase  48.41 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.531978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.72 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  45.32 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.24 
 
 		 485 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.37 
 
 		 468 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.37 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.42 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.63 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.52 
 
 		 476 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.16 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.77 
 
 		 474 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.09 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.77 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.63 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.63 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  42.37 
 
 		 468 aa  388  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  42.16 
 
 		 468 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.44 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2197  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  45.38 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000401969 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.95 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.37 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.16 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.7 
 
 		 482 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.95 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.44 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.16 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.58 
 
 		 489 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.44 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.21 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1676  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  41.28 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.890585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0197  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.11 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.77 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  44 
 
 		 470 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.77 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.07 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.4 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2752  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.07 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  42.44 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2561  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.94 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.53 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3824  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.96 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.75231  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.97 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  44.47 
 
 		 482 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.86 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.16 
 
 		 472 aa  377  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  42.86 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2816  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  46.7 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0492392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.68 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.44 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.74 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.45 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.74 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2762  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.9 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  43.13 
 
 		 482 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3445  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.99 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.76 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  44.07 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.74 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  40.98 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2102  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.42 
 
 		 479 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.157506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.74 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.23 
 
 		 482 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  41.74 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36670  6-phosphogluconate dehydrogenase  45.24 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26583  normal  0.322334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.45 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  40.8 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  44.87 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  43.78 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  42.98 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  43.67 
 
 		 486 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>