More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0925 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0925  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  978    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.83 
 
 
482 aa  590  1e-167  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  58.1 
 
 
483 aa  556  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.56 
 
 
482 aa  548  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.16 
 
 
489 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.7 
 
 
485 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  54.49 
 
 
482 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.39 
 
 
484 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.91 
 
 
484 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.7 
 
 
484 aa  532  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02427  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.06 
 
 
482 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 
482 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.57 
 
 
477 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01050  phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating), putative  57.43 
 
 
491 aa  522  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1654  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.94 
 
 
484 aa  519  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0057587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.96 
 
 
490 aa  518  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.53 
 
 
469 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.7 
 
 
474 aa  510  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.32 
 
 
471 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2752  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.39 
 
 
482 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2069  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.5 
 
 
479 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.531978  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0333  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.26 
 
 
479 aa  495  1e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69500  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.8 
 
 
508 aa  494  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239936  normal  0.16474 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03954  hypothetical protein similar to 6-phosphogluconate dehydrogenase (Eurofung)  53.18 
 
 
490 aa  489  1e-137  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0543109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.24 
 
 
468 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.03 
 
 
468 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.39 
 
 
468 aa  485  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.05 
 
 
490 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.91 
 
 
469 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  52.15 
 
 
482 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.91 
 
 
468 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.84 
 
 
471 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.41 
 
 
523 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.74 
 
 
472 aa  481  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.6 
 
 
468 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.222702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.28 
 
 
468 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.8 
 
 
469 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.61 
 
 
505 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.28 
 
 
468 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.8 
 
 
469 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.59 
 
 
469 aa  475  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.85 
 
 
468 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.49 
 
 
468 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.8 
 
 
469 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.13 
 
 
475 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.49 
 
 
468 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.39 
 
 
468 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  51.28 
 
 
468 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.1 
 
 
501 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.49 
 
 
468 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.49 
 
 
468 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.12 
 
 
469 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.06 
 
 
468 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.88 
 
 
482 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.85 
 
 
468 aa  472  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.32 
 
 
469 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.06 
 
 
469 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.06 
 
 
468 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.32 
 
 
469 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.28 
 
 
468 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.06 
 
 
469 aa  474  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  474  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.42 
 
 
473 aa  472  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.28 
 
 
468 aa  474  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.53 
 
 
471 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.06 
 
 
469 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.85 
 
 
468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.02 
 
 
484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.91 
 
 
469 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.11 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3505  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  48.5 
 
 
507 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.22 
 
 
470 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.16 
 
 
473 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2102  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.59 
 
 
479 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.157506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.16 
 
 
473 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.14 
 
 
479 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  48.73 
 
 
475 aa  463  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2449  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  51.29 
 
 
478 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  49.68 
 
 
476 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.81 
 
 
483 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000287104  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3359  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.85 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  49.68 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.01 
 
 
470 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.01 
 
 
470 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  48.85 
 
 
477 aa  461  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.01 
 
 
470 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.16 
 
 
478 aa  455  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.89 
 
 
468 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.89 
 
 
468 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.8 
 
 
470 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2812  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.11 
 
 
486 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0746874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.22 
 
 
470 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2762  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  50.64 
 
 
485 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2839  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.11 
 
 
486 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.01 
 
 
470 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2856  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.11 
 
 
486 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>