More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2210 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.93 
 
 		 468 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  73.5 
 
 		 468 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.93 
 
 		 468 aa  723    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.5 
 
 		 468 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.5 
 
 		 468 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.5 
 
 		 468 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  71.15 
 
 		 469 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  71.15 
 
 		 469 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.93 
 
 		 468 aa  724    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  97.65 
 
 		 469 aa  919    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 471 aa  837    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.5 
 
 		 468 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  71.58 
 
 		 468 aa  705    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.08 
 
 		 468 aa  719    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.65 
 
 		 468 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 471 aa  837    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.72 
 
 		 468 aa  715    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.38 
 
 		 470 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 470 aa  819    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 471 aa  837    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.65 
 
 		 468 aa  709    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.38 
 
 		 471 aa  841    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 471 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 471 aa  837    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  959    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  71.15 
 
 		 469 aa  708    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.5 
 
 		 468 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  69.23 
 
 		 469 aa  695    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  66.67 
 
 		 468 aa  669    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  73.93 
 
 		 468 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  85.96 
 
 		 471 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.6 
 
 		 470 aa  826    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.72 
 
 		 468 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.38 
 
 		 470 aa  822    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.29 
 
 		 468 aa  721    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  92.11 
 
 		 469 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.17 
 
 		 470 aa  822    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  67.8 
 
 		 472 aa  674    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.44 
 
 		 468 aa  715    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.6 
 
 		 470 aa  826    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.72 
 
 		 468 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  86.6 
 
 		 470 aa  826    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  69.66 
 
 		 471 aa  705    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  73.72 
 
 		 468 aa  721    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  64.53 
 
 		 477 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  63.35 
 
 		 475 aa  631  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  62.37 
 
 		 477 aa  630  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.34 
 
 		 478 aa  624  1e-177  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.01 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.01 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.56 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.69 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.69 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.56 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.69 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.69 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1071  6-phosphogluconate dehydrogenase  64.3 
 
 		 468 aa  591  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  57.45 
 
 		 476 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2810  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.61 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2765  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.61 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  59.02 
 
 		 479 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  58 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.17 
 
 		 471 aa  555  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.17 
 
 		 476 aa  545  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.13 
 
 		 486 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.11 
 
 		 490 aa  547  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.26 
 
 		 482 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.7 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.99 
 
 		 483 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.75 
 
 		 484 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.19 
 
 		 490 aa  538  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.08 
 
 		 482 aa  532  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3959  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.02 
 
 		 476 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1948  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.91 
 
 		 481 aa  532  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.78 
 
 		 473 aa  535  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.27 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.03 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.46 
 
 		 501 aa  529  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.03 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.51 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000287104  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0340  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.39 
 
 		 485 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.101232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.62 
 
 		 489 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3445  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.2 
 
 		 478 aa  528  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.27 
 
 		 484 aa  524  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4562  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.98 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.63 
 
 		 475 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3824  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.35 
 
 		 478 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.75231  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4789  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  55.51 
 
 		 486 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2816  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.29 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0492392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.48 
 
 		 483 aa  520  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4301  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.51 
 
 		 480 aa  521  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2102  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.62 
 
 		 479 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.157506 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1244  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.09 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3359  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.96 
 
 		 484 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2762  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.93 
 
 		 485 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.53 
 
 		 484 aa  519  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2812  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.06 
 
 		 486 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0746874  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.56 
 
 		 482 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2839  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.06 
 
 		 486 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2856  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.06 
 
 		 486 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>