More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1834 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  75.32 
 
 		 482 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.12 
 
 		 475 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.38 
 
 		 476 aa  753    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  74.79 
 
 		 471 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  981    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  75.53 
 
 		 476 aa  751    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.38 
 
 		 473 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  76.38 
 
 		 473 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  60.34 
 
 		 471 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  59.66 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  59.24 
 
 		 477 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2811  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  57.23 
 
 		 482 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.33 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  57.3 
 
 		 490 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.33 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.73 
 
 		 484 aa  558  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.96 
 
 		 468 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.75 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  57.96 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.84 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.96 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  57.75 
 
 		 468 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.96 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.84 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  58 
 
 		 474 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.84 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.75 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.11 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.93 
 
 		 471 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  56.4 
 
 		 490 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.54 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.54 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.51 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.51 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.51 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.51 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.51 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.51 
 
 		 471 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.11 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.54 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.9 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.32 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.05 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.26 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.32 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.32 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.32 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.32 
 
 		 468 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.78 
 
 		 469 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.86 
 
 		 483 aa  528  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.93 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1226  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.66 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.08 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09921  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.03 
 
 		 472 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.563524  normal  0.359209 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.08 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.08 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.51 
 
 		 484 aa  525  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  56.87 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1256  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.08 
 
 		 472 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.338914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.29 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2110  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.59 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.29 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.98 
 
 		 482 aa  522  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.79 
 
 		 484 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0758  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.89 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.08 
 
 		 470 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.2 
 
 		 469 aa  521  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0778  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.59 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08301  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.01 
 
 		 472 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16871  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.97 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0443  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.75 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08321  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.38 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.262984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08131  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.38 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.397468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.89 
 
 		 472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.27 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.05 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0176  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.91 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.05 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08081  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.91 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.055402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2765  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.94 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2810  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.94 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  53.28 
 
 		 475 aa  509  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32825  predicted protein  53.33 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.623455 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0397  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.49 
 
 		 468 aa  507  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1071  6-phosphogluconate dehydrogenase  57.69 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2599  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.07 
 
 		 523 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0892  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  52.84 
 
 		 477 aa  499  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.305911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  53.09 
 
 		 479 aa  495  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3445  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.54 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1950  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.13 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.4 
 
 		 483 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0339  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.29 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00114124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3824  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.38 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.75231  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1766  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.14 
 
 		 478 aa  489  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000232976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  51.38 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003325  6-phosphogluconate dehydrogenase decarboxylating  51.29 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0685  6-phosphogluconate dehydrogenase  49.89 
 
 		 482 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>