82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2009 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2009  sulfotransferase  100 
 
 
285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1715  hypothetical protein  46.86 
 
 
281 aa  249  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0404852 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1794  sulfotransferase  29.74 
 
 
308 aa  96.3  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1332  hypothetical protein  27.68 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000259253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2764  hypothetical protein  24.28 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  25.32 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  26.58 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  25.4 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  23.41 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  23.41 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  27.71 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.17 
 
 
832 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  26.11 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1622  hypothetical protein  24.8 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  29.1 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  26.12 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  23.69 
 
 
623 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  24.91 
 
 
681 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  24.26 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  25.51 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  23.21 
 
 
295 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1310  hypothetical protein  26.88 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0329016  normal  0.0607944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  28.21 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.79 
 
 
887 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  22.27 
 
 
281 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  23.45 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0289  hypothetical protein  20.8 
 
 
464 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0773  hypothetical protein  20.8 
 
 
464 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  26.37 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  24.47 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  26.01 
 
 
289 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3223  hypothetical protein  27.44 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0426372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.49 
 
 
676 aa  58.9  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  22.76 
 
 
682 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  28.57 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2737  hypothetical protein  23.63 
 
 
287 aa  57.4  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  23.87 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  23.87 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0205  hypothetical protein  24.91 
 
 
275 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  21.4 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  23.36 
 
 
285 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  22.94 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  26.16 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  22.36 
 
 
275 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25521  hypothetical protein  25.94 
 
 
283 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0946  sulfotransferase  23.66 
 
 
293 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  24 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0174  hypothetical protein  30 
 
 
276 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0591862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  25.21 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  26.53 
 
 
274 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  29.73 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4576  sulfotransferase  26.59 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.723483 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  23.75 
 
 
300 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  30.92 
 
 
328 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1828  sulfotransferase  25.25 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.436215  normal  0.012003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  24.55 
 
 
3045 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  28.48 
 
 
324 aa  49.3  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  26.1 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0090  hypothetical protein  29.38 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22840  sulfotransferase  22.87 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4269  sulfotransferase  24.9 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.19629 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4078  hypothetical protein  54.76 
 
 
124 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0379122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3141  sulfotransferase  25.09 
 
 
284 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.540594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8593  putative deacetylase sulfotransferase  24.5 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  28.48 
 
 
368 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45024  predicted protein  29.24 
 
 
560 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18680  sulfotransferase family protein  23.38 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  22.35 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0455  putative sulfotransferase protein  21.82 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  24.15 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  24.78 
 
 
260 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  28.3 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  27 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  23.11 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3873  hypothetical protein  28.25 
 
 
194 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.950409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  24.68 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  23.27 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  26 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  24.34 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  22.41 
 
 
303 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  26 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  23.25 
 
 
370 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>