28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1443 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1443  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  258  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4124  hypothetical protein  44.17 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0187  hypothetical protein  45.24 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4101  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0751717  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0119  hypothetical protein  39.18 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0226  hypothetical protein  34.23 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0501  hypothetical protein  41.46 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0662  hypothetical protein  41.46 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0222  hypothetical protein  35.09 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.958256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0312  hypothetical protein  36.27 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1231  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2206  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0943  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1929  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1675  hypothetical protein  35.29 
 
 
171 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1549  hypothetical protein  45.31 
 
 
217 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245035  normal  0.421629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6918  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.777422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2614  hypothetical protein  34.44 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4728  hypothetical protein  32.38 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.467083  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4024  hypothetical protein  28.92 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000625612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3504  hypothetical protein  31.82 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501161  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0937  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.753125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2636  protein of unknown function DUF1486  30.77 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000287228  hitchhiker  0.00453298 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1299  hypothetical protein  34.62 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1421  hypothetical protein  28.12 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3072  hypothetical protein  34.62 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409744  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4013  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2946  hypothetical protein  34.62 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>