26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2164 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2164  HD domain-containing protein  100 
 
 
182 aa  374  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1685  HD domain-containing protein  58.52 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0623  metal dependent phophohydrolase  54.75 
 
 
181 aa  202  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2541  metal dependent phophohydrolase  54.86 
 
 
180 aa  202  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.329168  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1620  HDIG  54.71 
 
 
181 aa  195  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0777771  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2393  metal dependent phosphohydrolase  53.07 
 
 
185 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000100641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1826  metal dependent phosphohydrolase  51.41 
 
 
185 aa  184  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2302  HD domain protein  49.44 
 
 
181 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1766  metal dependent phophohydrolase  48.04 
 
 
193 aa  174  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0651  HDIG domain-containing protein  45.05 
 
 
183 aa  168  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.236798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1286  HDIG  50.62 
 
 
165 aa  166  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000743318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2713  metal dependent phosphohydrolase  36.56 
 
 
198 aa  87.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.298031 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1555  putative HD superfamily hydrolase  37.12 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1246  hypothetical protein  33.99 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0195  metal-dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1151  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
221 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1034  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0597706 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1643  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
194 aa  61.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28416  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0912  metal dependent phosphohydrolase  30.3 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1034  metal dependent phosphohydrolase  31.4 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0373  hypothetical protein  33.88 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000409048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2796  metal dependent phosphohydrolase  34.25 
 
 
175 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1525  metal dependent phosphohydrolase  36.97 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2808  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0459  hypothetical protein  33.04 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1280  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 
165 aa  45.1  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.107883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>