33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0175 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0175  50S ribosomal protein L32e  100 
 
 		 153 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1866  50S ribosomal protein L32e  85.62 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1256  50S ribosomal protein L32e  86.93 
 
 		 153 aa  241  3e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2008  50S ribosomal protein L32e  84.87 
 
 		 157 aa  228  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0012  ribosomal protein L32e  46.72 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.118837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0239  ribosomal protein L32e  58.77 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0018  50S ribosomal protein L32e  47.62 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000000144632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1401  50S ribosomal protein L32e  41.46 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.763324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0727  50S ribosomal protein L32e  46.4 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.743255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1504  Ribosomal protein L32e  51.24 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000813977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0093  50S ribosomal protein L32e  41.18 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000176335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0162  50S ribosomal protein L32e  46.4 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000825784  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1257  50S ribosomal protein L32e  45.6 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0436378  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0661  50S ribosomal protein L32e  45.6 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.897537  hitchhiker  0.000933847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0391  50S ribosomal protein L32e  46.96 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.181601 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  46.83 
 
 		 335 aa  97.4  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2235  Ribosomal protein L32e  45.52 
 
 		 236 aa  95.5  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1711  ribosomal protein L32e  46.03 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00675824  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0459  50S ribosomal protein L32e  45.45 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.025881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0108  50S ribosomal protein L32e  44.72 
 
 		 134 aa  92  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.00000000000970998  unclonable  0.000000353529 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1761  Ribosomal protein L32e  42.4 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.179144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1845  Ribosomal protein L32e  45.86 
 
 		 240 aa  91.3  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0227  Ribosomal protein L32e  44.03 
 
 		 240 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209595  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0581  50S ribosomal protein L32e  46.34 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0869407  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2432  50S ribosomal protein L32e  50 
 
 		 236 aa  87.8  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0098  50S ribosomal protein L32e  40.48 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.965997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2236  50S ribosomal protein L32e  44.09 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000681185  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0549  ribosomal protein L32e  43.55 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0692327  normal  0.362296 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02240  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0914948  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21659  predicted protein  29.01 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07354  60S ribosomal protein L32 (AFU_orthologue; AFUA_2G16370)  34.78 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.399241 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83982  predicted protein  33.91 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.958141  normal  0.216433 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86947  predicted protein  34.04 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0883388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>