41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1807 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1807  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03935  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  36.87 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2915  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.418761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3247  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3620  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.41 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3196  hypothetical protein  30.88 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.144092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3190  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0211783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3146  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0876  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1044  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.523341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3328  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1032  extracellular solute-binding protein family 3  31.58 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.267396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4114  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  31.19 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4021  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  31.19 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3921  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2979  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3998  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  31.19 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1011  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3307  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3276  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  30.09 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0704  putative amino acid-binding protein  29.73 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.440677  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2793  putative amino acid-binding protein  30.47 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3920  putative amino acid-binding protein  28.51 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.21 
 
 		 2213 aa  91.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0627  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  25.46 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.225445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3588  hypothetical protein  26.01 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.623219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0850  hypothetical protein  26.2 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000173614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1591  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.115336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3267  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  24.71 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0551  hypothetical protein  21.12 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.831394  decreased coverage  0.00317207 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1048  ABC-type amino acid transport/signal transduction systems  27.6 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  21.15 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2369  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  21 
 
 		 233 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  23.87 
 
 		 294 aa  45.4  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4388  amino acid ABC transporter  25.4 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000078049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.14 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0410  putative cation efflux protein  21.1 
 
 		 251 aa  43.5  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0293861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 425 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  24.35 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>