More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2114 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2114  putative alcohol dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  665    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1770  putative alcohol dehydrogenase  82.12 
 
 
331 aa  518  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.754529  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0785  putative alcohol dehydrogenase  77.2 
 
 
331 aa  495  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0151749  normal  0.604245 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0882  putative alcohol dehydrogenase  76.97 
 
 
331 aa  455  1e-127  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0305  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  42.72 
 
 
336 aa  248  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1426  putative alcohol dehydrogenase  42.26 
 
 
332 aa  237  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.967843  normal  0.34363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1823  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  40.06 
 
 
333 aa  235  9e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0398  alcohol dehydrogenase  36.23 
 
 
315 aa  197  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.859369  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1615  putative alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
332 aa  196  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.923405  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 
341 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.95 
 
 
336 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
336 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0639  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
322 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000239851  hitchhiker  0.000149204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0234  alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 
346 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1545  alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
322 aa  149  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0146504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.9 
 
 
342 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
342 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
342 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  31.16 
 
 
343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.88 
 
 
335 aa  147  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 
357 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.11 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.2 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.2 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0148  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.59 
 
 
331 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  32.14 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.88 
 
 
340 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
340 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  33.14 
 
 
340 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.54 
 
 
351 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.55 
 
 
341 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 
342 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  32.44 
 
 
341 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
337 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.59 
 
 
346 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.85 
 
 
337 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
342 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
341 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.77 
 
 
342 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
344 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.53 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.99 
 
 
350 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  31.86 
 
 
344 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  29.88 
 
 
347 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.91 
 
 
368 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  30.77 
 
 
342 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
348 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  33.22 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0678  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.65 
 
 
310 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.211345  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.36 
 
 
341 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07850  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  35.59 
 
 
344 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
344 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.8 
 
 
342 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  29.41 
 
 
344 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1270  alcohol dehydrogenase class III  33.66 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.303714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.29 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4805  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  41.79 
 
 
351 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.983858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.57 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  33.22 
 
 
338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1696  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.95 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.558664  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
344 aa  133  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
340 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1718  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.71 
 
 
346 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271059  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.82 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  32.25 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.33 
 
 
346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 
350 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.82 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  31.64 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  32.38 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  31.29 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.09 
 
 
342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.18 
 
 
341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.97 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_27980  alcohol dehydrogenase  30.47 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.44 
 
 
351 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  31.95 
 
 
341 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.79 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
350 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.7 
 
 
342 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1684  alcohol dehydrogenase  30.15 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.900502  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.79 
 
 
336 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.53 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1980  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.6 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22500  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  36.99 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.773326  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  29.91 
 
 
358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0617  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.79 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>