33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0181 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  100 
 
 		 83 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  60.24 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2481  hypothetical protein  59.04 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  42.03 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  42.86 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  42.03 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.26 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2602  Excinuclease ABC C subunit domain protein  45.45 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000820325  normal  0.0436651 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.11 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05230  hypothetical protein  36.62 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610254  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0446  excinuclease ABC subunit C  44.64 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029981  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  37.68 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2227  excinuclease ABC subunit C  43.64 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000408802  hitchhiker  0.0000527007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.87 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.53 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4363  excinuclease ABC, C subunit-like protein  39.19 
 
 		 91 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.07 
 
 		 84 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0376  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.604182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1525  endonuclease  41.67 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0778  hypothetical protein  41.07 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.68184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  32.81 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7672  Excinuclease ABC C subunit domain protein  37.5 
 
 		 104 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>