91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02858 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02858  drug/metabolite transporter superfamily protein  100 
 
 		 113 aa  216  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  61.54 
 
 		 301 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  53.19 
 
 		 316 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  51.55 
 
 		 306 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.04 
 
 		 310 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  51.55 
 
 		 304 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  51.55 
 
 		 306 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  51.55 
 
 		 306 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  48.45 
 
 		 304 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  48.39 
 
 		 296 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  47.87 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  48.45 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  46.81 
 
 		 296 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  46.81 
 
 		 296 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  46.81 
 
 		 296 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  43.75 
 
 		 311 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  44.09 
 
 		 309 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.74 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  42.55 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  40.82 
 
 		 292 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  44.33 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  45.1 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  44.55 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  42.71 
 
 		 311 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  46.81 
 
 		 304 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  37.37 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  38.98 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  37.23 
 
 		 302 aa  53.9  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  32.63 
 
 		 305 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.74 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  45.74 
 
 		 306 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  31.58 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  32.63 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  31.58 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  31.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  31.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  31.58 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  38.89 
 
 		 299 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  34 
 
 		 318 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  31.58 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.46 
 
 		 314 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 321 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.4 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  36.46 
 
 		 494 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.4 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  40.4 
 
 		 296 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  31.58 
 
 		 305 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  36.46 
 
 		 392 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  36.46 
 
 		 402 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  36.46 
 
 		 400 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  36.46 
 
 		 400 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.96 
 
 		 321 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  36.46 
 
 		 392 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  39.56 
 
 		 296 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  38.61 
 
 		 325 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  42.57 
 
 		 312 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.49 
 
 		 304 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.87 
 
 		 299 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  34.85 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 		 295 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  34.38 
 
 		 414 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 317 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>