299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02557 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  95.6 
 
 
846 bp  892    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02557    100 
 
 
546 bp  1082    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.141347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  93.96 
 
 
846 bp  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02741    93.68 
 
 
783 bp  765    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04078    93.21 
 
 
486 bp  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.532563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04015    97.88 
 
 
783 bp  854    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01970    97.24 
 
 
483 bp  831    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00429349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  94.53 
 
 
648 bp  793    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  94.69 
 
 
546 bp  852    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  93.96 
 
 
846 bp  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03027    93.42 
 
 
486 bp  710    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  97.95 
 
 
486 bp  878    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  95.79 
 
 
846 bp  900    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  96.15 
 
 
846 bp  916    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01537    94.51 
 
 
807 bp  844    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  95.4 
 
 
846 bp  878    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  93.96 
 
 
546 bp  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01848    93.43 
 
 
786 bp  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02780    93.55 
 
 
759 bp  799    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  96.52 
 
 
846 bp  932    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02481    92.67 
 
 
546 bp  765    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  95.79 
 
 
846 bp  900    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03281    94.32 
 
 
546 bp  837    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02902    92.81 
 
 
786 bp  680    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  93.22 
 
 
846 bp  789    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03796    93.96 
 
 
546 bp  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  93.04 
 
 
846 bp  781    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  97.25 
 
 
846 bp  963    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  93.96 
 
 
546 bp  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  95.4 
 
 
846 bp  878    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03666    93.96 
 
 
816 bp  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  93.77 
 
 
546 bp  813    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01935    97.68 
 
 
345 bp  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  97.68 
 
 
345 bp  620  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  92.97 
 
 
426 bp  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  96.33 
 
 
726 bp  414  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03626  transposase  95.02 
 
 
261 bp  319  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01967  hypothetical protein  97.52 
 
 
177 bp  287  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00113705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04084  transposase  96.93 
 
 
189 bp  283  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01542    88.44 
 
 
531 bp  232  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  88 
 
 
774 bp  224  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  83.28 
 
 
318 bp  192  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  89.43 
 
 
525 bp  141  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00856  hypothetical protein  84.11 
 
 
153 bp  109  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00434915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06071  hypothetical protein  84.11 
 
 
153 bp  109  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000238021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  89.47 
 
 
528 bp  109  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  96.43 
 
 
357 bp  95.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  96.43 
 
 
498 bp  95.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04489    96.43 
 
 
357 bp  95.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1279  putative transposase  84.34 
 
 
264 bp  61.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0690484  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
723 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3492  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1523  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1542  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1688  IS1404 transposase  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.722668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1715  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0670836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1793  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1818  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.961912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2101  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2202  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0113  IS1404 transposase  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0152  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
723 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  86.36 
 
 
834 bp  60  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>