119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01948 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01948  xylanase  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2906  xylanase  50 
 
 
319 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4537  xylanase  45.53 
 
 
301 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664665  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2001  xylanase  45.9 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.554874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5554  xylanase  41.28 
 
 
286 aa  168  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0342677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2905  xylanase  38.25 
 
 
333 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.641285  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1921  hypothetical protein  38.94 
 
 
327 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0855  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  38.52 
 
 
404 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4266  esterase/lipase-like protein  35.32 
 
 
309 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2039  pectin acetylesterase  35.48 
 
 
314 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.773427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0612  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  38.52 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936989  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2345  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  38.52 
 
 
417 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1044  putative acetylesterase  38.52 
 
 
326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.475385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1129  putative acetylesterase  38.37 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3552  hypothetical protein  35.8 
 
 
328 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1954  pectin acetylesterase  36.4 
 
 
308 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3521  esterase/lipase-like protein  38.86 
 
 
333 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4918  putative esterase/lipase precursor  34.39 
 
 
299 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.220535  normal  0.753644 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1902  pectin acetylesterase  34.25 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3894  esterase/lipase-like protein  35.29 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.6 
 
 
326 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.984034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3062  esterase/lipase-like protein  33.98 
 
 
333 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.851787  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2195  pectin acetylesterase  33.47 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1964  pectin acetylesterase  34.32 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.235642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1345  alpha/beta hydrolase  36.4 
 
 
305 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0283  esterase/lipase  35.32 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0225  pectin acetylesterase  37.5 
 
 
324 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0473386  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1292  hypothetical protein  36.92 
 
 
353 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1417  esterase/lipase  33.33 
 
 
310 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.895698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3550  alpha/beta hydrolase  34.55 
 
 
306 aa  122  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0287748  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0088  hypothetical protein  40.58 
 
 
337 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3038  hypothetical protein  36.23 
 
 
323 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463751  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000919  endo-1,4-beta-xylanase  36.11 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1805  Esterase/lipase  37.2 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.90276  hitchhiker  0.0000000160109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2025  Alpha/beta hydrolase  39.25 
 
 
301 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0965  hypothetical protein  35.35 
 
 
337 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1536  hypothetical protein  39.81 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3031  hypothetical protein  33.48 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0181  hypothetical protein  36.1 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.799105  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0188  Esterase/lipase-like protein  34.26 
 
 
346 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.871358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3159  hypothetical protein  36.28 
 
 
342 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526515  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2933  hypothetical protein  36.28 
 
 
342 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131666 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2213  esterase/lipase-like protein  35.27 
 
 
267 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000722209  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3975  hypothetical protein  32.77 
 
 
289 aa  107  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3784  hypothetical protein  38.71 
 
 
303 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3115  hypothetical protein  34.25 
 
 
342 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1651  hypothetical protein  40.4 
 
 
339 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.744803  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1924  pectin acetylesterase  37.69 
 
 
319 aa  102  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000155025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2431  endo-1,4-beta-xylanase  30.25 
 
 
291 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0212534  normal  0.300404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2181  putative lipase/esterase  38.54 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144182 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2345  hypothetical protein  31.63 
 
 
274 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0788  esterase/lipase-like  31.9 
 
 
305 aa  89.7  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2271  alpha/beta hydrolase  31.09 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2427  endo-1,4-beta-xylanase B  32.29 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.740371  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01320  conserved hypothetical protein  30.48 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000546639  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1725  hypothetical protein  35.61 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2402  hypothetical protein  31.43 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.50924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1475  esterase/lipase  30.39 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3216  hypothetical protein  31.4 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.476052  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0112  esterase/lipase  27.04 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  7.81923e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1216  putative esterase  26.13 
 
 
287 aa  62  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.274462  normal  0.128321 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1260  lipase/esterase family protein  26.24 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0485  esterase/lipase  23.96 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2793  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  26.36 
 
 
420 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3014  acetyl esterase  28.49 
 
 
277 aa  55.8  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4378  Esterase/lipase-like protein  25.23 
 
 
317 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.222485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1821  putative esterase/lipase/thioesterase  29.82 
 
 
328 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0370095  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0809  xylanase  34.81 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1585  dienelactone hydrolase  32.52 
 
 
323 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.144212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22340  esterase/lipase  32.29 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0486  Pectinesterase  31.19 
 
 
644 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536234  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2860  carboxylesterase Est2  27.1 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0015  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  28.06 
 
 
344 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2516  Esterase/lipase-like protein  32.04 
 
 
329 aa  50.1  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228669  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1712  esterase/lipase-like protein  27.56 
 
 
334 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0810  hypothetical protein  29.11 
 
 
275 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2589  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.38 
 
 
300 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36320  esterase/lipase  28.76 
 
 
353 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4253  esterase/lipase-like protein  30.48 
 
 
318 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4383  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.57 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1562  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.43 
 
 
293 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11455  esterase lipO  26.24 
 
 
420 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0696571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.23 
 
 
292 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1433  exported protein precursor  26.43 
 
 
326 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0202  Alpha/beta hydrolase fold-3  23.08 
 
 
407 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0211  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.08 
 
 
407 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.54 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0191  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.33 
 
 
407 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0661  esterase/lipase-like protein  31.96 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0519166  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04833  esterase/lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07260)  32.09 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.372653  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0227  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31 
 
 
407 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.139422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0436  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.48 
 
 
422 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3898  hypothetical protein  24.28 
 
 
358 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10222  esterase lipC  23.76 
 
 
403 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.480215  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0231  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  23.38 
 
 
412 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  30.89 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1001  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.48 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0440  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  24.51 
 
 
409 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116329  normal  0.623779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.17 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4391  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  27.61 
 
 
294 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>