297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01537 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02902    96.77 
 
 
786 bp  1275    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01970    93.84 
 
 
483 bp  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00429349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01537    100 
 
 
807 bp  1600    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.502784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04015    94.89 
 
 
783 bp  1142    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01072  ISXoo3 transposase ORF B  93.02 
 
 
846 bp  1146    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03027    98.56 
 
 
486 bp  908    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04488  transposase  98.36 
 
 
426 bp  783    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  94.37 
 
 
846 bp  1227    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01848    97.7 
 
 
786 bp  1322    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01541  transposase  98.55 
 
 
345 bp  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.728343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02557    94.51 
 
 
546 bp  844    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.141347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02530  ISXoo3 transposase ORF B  93.84 
 
 
486 bp  720    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01161  transposase  99.41 
 
 
648 bp  991    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03666    97.51 
 
 
816 bp  1431    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02780    96.44 
 
 
759 bp  1291    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  93.87 
 
 
846 bp  1195    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  96.72 
 
 
774 bp  833    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01542    96.49 
 
 
531 bp  817    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  97.13 
 
 
846 bp  1407    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02161  transposase  98.35 
 
 
546 bp  1011    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01958  transposase  92.76 
 
 
726 bp  700    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.064583  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02564  transposase  99.08 
 
 
546 bp  1043    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02481    97.44 
 
 
546 bp  971    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01935    98.55 
 
 
345 bp  644    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00281  transposase  98.17 
 
 
546 bp  1003    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02741    99.36 
 
 
783 bp  1505    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  97.76 
 
 
846 bp  1447    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03796    98.35 
 
 
546 bp  1011    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03720  transposase  98.35 
 
 
546 bp  1011    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03281    98.72 
 
 
546 bp  1027    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357178  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  95.74 
 
 
846 bp  1312    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  96.12 
 
 
846 bp  1336    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04078    98.35 
 
 
486 bp  900    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.532563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  96.12 
 
 
846 bp  1338    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  97.51 
 
 
846 bp  1431    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  95.36 
 
 
846 bp  1289    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06246  ISXoo3 transposase ORF B  93.02 
 
 
846 bp  1146    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  94.37 
 
 
846 bp  1227    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03026  transposase  96.12 
 
 
357 bp  517  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04489    95.47 
 
 
357 bp  502  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  94.5 
 
 
498 bp  478  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00732  transposase  90.77 
 
 
525 bp  474  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.593212  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02482  transposase  96.05 
 
 
300 bp  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03280  transposase  96 
 
 
309 bp  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.495134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  95.67 
 
 
450 bp  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02556  transposase  95.65 
 
 
300 bp  414  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100793  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02571  transposase  95.31 
 
 
414 bp  412  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01971  transposase  95.95 
 
 
294 bp  410  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0526075  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02529  transposase  95.6 
 
 
300 bp  408  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00282    95.28 
 
 
309 bp  408  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00700  transposase  93.2 
 
 
300 bp  361  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.782248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03626  transposase  96.02 
 
 
261 bp  335  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02162    94.79 
 
 
222 bp  331  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796965  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03721    94.79 
 
 
222 bp  331  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01377  transposase  88.85 
 
 
318 bp  327  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01967  hypothetical protein  97.52 
 
 
177 bp  287  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00113705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04084  transposase  95.71 
 
 
189 bp  268  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00239  transposase  84.2 
 
 
528 bp  268  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  98.92 
 
 
393 bp  176  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  98.88 
 
 
399 bp  168  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  98.88 
 
 
399 bp  168  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01378  transposase  88.7 
 
 
195 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00856  hypothetical protein  83.67 
 
 
153 bp  101  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00434915  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06071  hypothetical protein  83.67 
 
 
153 bp  101  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000238021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  100 
 
 
696 bp  75.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  94.59 
 
 
792 bp  58  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    89.13 
 
 
691 bp  52  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1279  putative transposase  82.93 
 
 
264 bp  52  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0690484  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1119    84.85 
 
 
741 bp  52  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6141    83.33 
 
 
93 bp  52  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.621945 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3193  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00220403  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0916  IS1404 transposase  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.08835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1523  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1542  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1654  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1688  IS1404 transposase  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.722668  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1715  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0670836  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1793  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1818  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.961912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1837  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00170274  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1940  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2092  IS1404 transposase  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.702251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1960  IS407A, transposase OrfB  84.62 
 
 
834 bp  50.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.230927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>