64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5387 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5387  stability cassette protein, putative  100 
 
 		 96 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2079  addiction module toxin, RelE/StbE family  71.28 
 
 		 95 aa  143  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00218718  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0018  toxin RelE  71.28 
 
 		 95 aa  143  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2072  addiction module antitoxin  71.28 
 
 		 95 aa  143  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2227  addiction module antitoxin  68.09 
 
 		 94 aa  136  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0239944  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4469  addiction module toxin, RelE/StbE family  69.15 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505994  normal  0.573834 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4332  addiction module toxin, RelE/StbE family  69.15 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4397  addiction module antitoxin  69.15 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  0.935834 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4647  addiction module antitoxin  69.15 
 
 		 94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0708  addiction module toxin, RelE/StbE family  63.83 
 
 		 94 aa  127  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0435  addiction module antitoxin  68.09 
 
 		 94 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4830  putative stability protein StbE  69.15 
 
 		 94 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0115  putative stability protein StbE  66.67 
 
 		 93 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000821269  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4701  putative stability protein StbE  70.21 
 
 		 94 aa  116  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.86483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4851  putative stability protein StbE  70.21 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4796  putative stability protein StbE  69.15 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4716  addiction module toxin RelE  59.57 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2439  RelE protein  59.57 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1208  plasmid stabilization system protein  76.81 
 
 		 81 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4546  addiction module antitoxin  61.29 
 
 		 95 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2258  addiction module toxin, RelE/StbE family  55.79 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000000447442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3849  addiction module antitoxin  57.45 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000246767 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4314  addiction module antitoxin  51.06 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100162  hitchhiker  0.0025912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1655  putative stability protein StbE  54.84 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1619  putative stability protein StbE  54.84 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.476443  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1721  putative stability protein StbE  53.76 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1012  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.99 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.247568  hitchhiker  0.000000000573461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0890  stability protein StbE, putative  56.99 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5382  addiction module antitoxin  56.99 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.584673 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3785  stability protein StbE  54.84 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1469  putative plasmid stabilisation system protein  55.32 
 
 		 94 aa  100  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.165331  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0823  hypothetical protein  57.45 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.382841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4185  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.06 
 
 		 95 aa  100  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3833  plasmid stabilization system protein  60 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4836  addiction module antitoxin  55.91 
 
 		 93 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0319  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.69 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0691287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0794  hypothetical protein  51.58 
 
 		 96 aa  97.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.385271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1073  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.87 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.588523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1758  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.39 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44980  Cytotoxin, RelE protein  61.29 
 
 		 93 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3688  addiction module antitoxin  55.91 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125211  normal  0.144102 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0089  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.735538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00613  putative relE protein  62.77 
 
 		 97 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.164171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0155  plasmid stabilization system protein  59.21 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2746  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.69 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1588  hypothetical protein  56.16 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5358  plasmid stabilization system protein  58.33 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5502  plasmid stabilization system protein  58.33 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.518192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3376  addiction module antitoxin  48.86 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4264  hypothetical protein  72.92 
 
 		 49 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4228  hypothetical protein  70.83 
 
 		 49 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0244  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.31 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1119  addiction module toxin, RelE/StbE  54.84 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.197659  normal  0.189109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1266  hypothetical protein  54.84 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0704408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4769  plasmid stabilization system protein  64 
 
 		 50 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0840  putative inner membrane protein  58.49 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1997  addiction module antitoxin  75 
 
 		 37 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.67699  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3603  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4263  hypothetical protein  76.47 
 
 		 35 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4227  hypothetical protein  76.47 
 
 		 35 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0782  plasmid stabilization system  44.9 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2497  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03534  hypothetical protein  58.82 
 
 		 48 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0823  plasmid stabilization system  31.4 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.305872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>