19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3078 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3078  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2935  hypothetical protein  93.75 
 
 		 128 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3782  hypothetical protein  44.07 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00124046  normal  0.0210619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2244  hypothetical protein  31.3 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.60007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0564  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.494906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0622  hypothetical protein  29.31 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3488  hypothetical protein  26.72 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4537  hypothetical protein  26.09 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0772957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4272  hypothetical protein  26.96 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.967441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5654  hypothetical protein  24.17 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.040863 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4554  hypothetical protein  24.77 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2268  hypothetical protein  24.77 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000109441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0763  hypothetical protein  24.37 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2672  hypothetical protein  27.2 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1331  hypothetical protein  19.44 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0543  hypothetical protein  19.44 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0612  hypothetical protein  19.44 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0376517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2896  putative dehydrogenase  23.08 
 
 		 132 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>