46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4939 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  75.5 
 
 		 452 aa  643    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  70.63 
 
 		 441 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  72.87 
 
 		 445 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  966    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  73.54 
 
 		 444 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  72.65 
 
 		 445 aa  653    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  97.31 
 
 		 446 aa  833    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  74.73 
 
 		 458 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  73.54 
 
 		 443 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  73.5 
 
 		 448 aa  631  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  72.65 
 
 		 445 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  61.71 
 
 		 435 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  59.36 
 
 		 420 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  60.61 
 
 		 423 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  60.96 
 
 		 431 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  59.39 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  54.74 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  54.74 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  54.26 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  52.96 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  50 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  50.86 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  51.66 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  53.61 
 
 		 422 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  50.25 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  51.81 
 
 		 426 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  50 
 
 		 424 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  48.21 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  42.86 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  46.65 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  42.29 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  42.29 
 
 		 480 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  45.19 
 
 		 428 aa  299  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  39.7 
 
 		 441 aa  282  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  45.93 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  43.8 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  42.56 
 
 		 399 aa  264  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  35.59 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  38.17 
 
 		 429 aa  236  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  24.83 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  31.33 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.49 
 
 		 387 aa  50.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  22.39 
 
 		 384 aa  47.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  23.93 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  28 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 381 aa  43.5  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>