More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2936 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  86.36 
 
 
539 aa  946    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  57.94 
 
 
541 aa  652    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  58.96 
 
 
569 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  62.66 
 
 
540 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  85.61 
 
 
539 aa  938    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  56.75 
 
 
541 aa  651    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  60.94 
 
 
539 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  85.98 
 
 
539 aa  943    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  82.99 
 
 
541 aa  930    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
541 aa  1103    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  83.65 
 
 
534 aa  920    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  59.52 
 
 
546 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  81.89 
 
 
541 aa  918    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  56.56 
 
 
541 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  58.77 
 
 
542 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  62.29 
 
 
541 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  85.79 
 
 
539 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 
542 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 
541 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  82 
 
 
459 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  61.32 
 
 
539 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  58.58 
 
 
545 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 
542 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 
542 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  99.08 
 
 
541 aa  1095    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  58.58 
 
 
542 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  83.36 
 
 
541 aa  932    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  60.26 
 
 
541 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  55.83 
 
 
536 aa  633  1e-180  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  56.24 
 
 
540 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  55.68 
 
 
526 aa  625  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  55.68 
 
 
542 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  56.07 
 
 
540 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  55.24 
 
 
524 aa  606  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  55.17 
 
 
560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  42.21 
 
 
588 aa  403  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.95 
 
 
479 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.68 
 
 
477 aa  249  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.68 
 
 
479 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.72 
 
 
479 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.72 
 
 
479 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.49 
 
 
479 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.49 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.49 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.49 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.49 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  34.51 
 
 
457 aa  242  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  32.26 
 
 
479 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  31.87 
 
 
466 aa  237  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  31.95 
 
 
479 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.87 
 
 
471 aa  232  1e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.87 
 
 
482 aa  226  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.34 
 
 
482 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  30.63 
 
 
476 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.12 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.11 
 
 
475 aa  209  2e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  32.01 
 
 
482 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.22 
 
 
472 aa  207  4e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  31.29 
 
 
477 aa  206  7e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2361  aldehyde dehydrogenase  31.84 
 
 
683 aa  176  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.536746  normal  0.202698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000636  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.48 
 
 
506 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  29.19 
 
 
500 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
484 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 
484 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  29.61 
 
 
489 aa  172  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.49 
 
 
498 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  28.36 
 
 
484 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  29.06 
 
 
484 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  27.49 
 
 
477 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
484 aa  171  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1966  Aldehyde Dehydrogenase  29.21 
 
 
478 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.57596 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  29.06 
 
 
484 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  28.83 
 
 
484 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.27 
 
 
499 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
484 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1454  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  29.29 
 
 
480 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.278673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  28.82 
 
 
486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.47 
 
 
484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  27.53 
 
 
479 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  28.78 
 
 
480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.73 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  28.07 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3072  nonphosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  29.57 
 
 
495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.828491  normal  0.0296482 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0060  succinate semialdehyde dehydrogenase  29.45 
 
 
507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.455704  hitchhiker  0.00355427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2222  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  28.73 
 
 
489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0132587  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  29.85 
 
 
488 aa  163  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0509  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (acylating)  26.63 
 
 
491 aa  163  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0997846  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 
484 aa  163  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1111  Aldehyde Dehydrogenase  31.92 
 
 
533 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5184  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.67 
 
 
484 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000798563  normal  0.630733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  29.34 
 
 
485 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  29.91 
 
 
486 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4318  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
499 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.140672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  29.34 
 
 
482 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4428  succinic semialdehyde dehydrogenase  28.54 
 
 
499 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.111659  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4656  aldehyde dehydrogenase  28.44 
 
 
484 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  28.63 
 
 
487 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2725  succinate semialdehyde dehydrogenase  30.06 
 
 
515 aa  160  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.774266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  29.98 
 
 
486 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1629  Aldehyde Dehydrogenase  28.34 
 
 
496 aa  159  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>