34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0700 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  99.35 
 
 		 153 aa  312  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0583  putative phage head completeion protein  41.26 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2763  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  35.95 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1468  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  35.95 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0243  head completion protein  43.17 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  35.06 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  38.13 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  32.45 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  36.6 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  31.79 
 
 		 167 aa  87  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  32.89 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1031  probable head completion/stabilization protein  31.37 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0699  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  30.07 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  31.01 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05029  hypothetical protein  34.93 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  32.62 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  32.68 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  26.8 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1287  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0725  hypothetical protein  29.69 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  27.92 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  30.72 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  30.72 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  30.72 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  30.77 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  29.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  27.34 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  26.62 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  26.63 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  25.17 
 
 		 172 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  29.93 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  25.48 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  25.64 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>