30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3293 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  51.27 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  46.25 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  44.81 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  47.89 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  44.16 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  44.16 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  46.5 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  44.16 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  46.75 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  46.72 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  43.14 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  41.89 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3497  phage head completion  40.74 
 
 		 167 aa  114  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4369  phage head completion protein  40 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  hitchhiker  0.00000000450076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  43.92 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  41.48 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  41.48 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  42.45 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  41.73 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  37.84 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  32.67 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  34.65 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  26.8 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  26.8 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  27.92 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  27.92 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  26.53 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  27.66 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1031  probable head completion/stabilization protein  27.78 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>