26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2645 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  100 
 
 
168 aa  337  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  48.52 
 
 
163 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  43.45 
 
 
153 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  46.62 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  41.67 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  43.92 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  38.1 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  38.18 
 
 
163 aa  104  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  39.58 
 
 
167 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  39.18 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  38.57 
 
 
154 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  38.57 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  37.86 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  37.86 
 
 
154 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  41.01 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3497  phage head completion  35.56 
 
 
167 aa  91.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4369  phage head completion protein  36.57 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  hitchhiker  0.00000000450076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  36.55 
 
 
155 aa  87.8  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  37.5 
 
 
169 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  36.03 
 
 
157 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  33.33 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  29.58 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  26.35 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  26.63 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  26.63 
 
 
153 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  26.03 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>