33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0203 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  100 
 
 
160 aa  322  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  82.5 
 
 
158 aa  264  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  49.38 
 
 
154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  50 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  53.96 
 
 
154 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  49.38 
 
 
154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  48.75 
 
 
154 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  48.43 
 
 
163 aa  143  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  46.25 
 
 
154 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  44.38 
 
 
153 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  46.54 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  51.8 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  46.98 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  47.97 
 
 
167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  47.89 
 
 
156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3497  phage head completion  44.59 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  42.45 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  42.45 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  39.86 
 
 
163 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  38.1 
 
 
168 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4369  phage head completion protein  42.45 
 
 
166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  hitchhiker  0.00000000450076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  32.62 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  32.62 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  30.07 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  30.77 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  34.38 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  34.38 
 
 
167 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  29.37 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  30.85 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0583  putative phage head completeion protein  27.94 
 
 
161 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1468  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  26.39 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2763  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  26.39 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0243  head completion protein  30.85 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>