28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3048 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  100 
 
 
157 aa  320  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  99.36 
 
 
169 aa  318  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4369  phage head completion protein  73.51 
 
 
166 aa  237  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  hitchhiker  0.00000000450076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3497  phage head completion  72.19 
 
 
167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  61.59 
 
 
167 aa  201  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  40.62 
 
 
175 aa  128  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  41.72 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  41.72 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  41.72 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  46.36 
 
 
159 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  43.04 
 
 
158 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  42.45 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  41.48 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  45.74 
 
 
154 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  42.45 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  41.55 
 
 
172 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  36.84 
 
 
153 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  40 
 
 
163 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  38.67 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2645  head completion protein  36.03 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00983423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  31.69 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  27.27 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  29.05 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  31.63 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  31.63 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  26 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  25.48 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  25.48 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>