37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2932 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  100 
 
 
167 aa  347  6e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  98.8 
 
 
167 aa  343  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  60.67 
 
 
150 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  60 
 
 
150 aa  179  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  54 
 
 
150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  43.14 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1031  probable head completion/stabilization protein  44.74 
 
 
154 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  32.45 
 
 
153 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  32.45 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0583  putative phage head completeion protein  35.25 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  32.63 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3293  phage head completion  26.8 
 
 
154 aa  60.8  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0203  head completion protein  34.38 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  32.17 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0699  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  27.68 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2763  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  30.22 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1468  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  30.22 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  27.21 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  26.57 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0928  phage head completion protein  26.57 
 
 
175 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0725  hypothetical protein  31.34 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1348  fels-2 prophage protein  28.37 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.897085  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2773  head completion protein  27.21 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.572035  decreased coverage  0.0000162418 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1287  hypothetical protein  27.54 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0243  head completion protein  40.74 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3175  head completion protein  31.63 
 
 
167 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3497  phage head completion  31.96 
 
 
167 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2331  head completion protein  27.27 
 
 
163 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0208821  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3829  head completion protein  27.69 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  30.28 
 
 
154 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4327  phage head completion protein GPL  31.63 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052773 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05029  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3048  phage head completion protein GPL  31.63 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000100295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  21.68 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1935  bacteriophage protein  29.17 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717777  normal  0.789532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01359  phage head completion protein (GPL)  27.27 
 
 
155 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0304112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4369  phage head completion protein  28.57 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  hitchhiker  0.00000000450076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>