20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0699 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0699  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  100 
 
 		 151 aa  314  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0700  phage head completion protein  30.07 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5056  phage head completion protein  30.07 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.112849  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2796  phage head completion protein  33.63 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2932  phage head completion protein  27.68 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.8004599999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1053  phage head completion protein (GPL)  33.59 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0583  putative phage head completeion protein  25.58 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.804364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3488  phage head completion protein  27.68 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.560550000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1468  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  27.73 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2763  prophage PSPPH06, putative head completion/stabilization protein  27.73 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0939  head completion protein  30.77 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2912  head completion protein  29.3 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.490459  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0901  head completion protein  28.16 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0914699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0243  head completion protein  27.27 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1395  phage head completion  29.29 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1031  probable head completion/stabilization protein  30.2 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37570  Phage P2 capsid completion gpL-like protein  27.5 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620927  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4839  head completion protein  31.18 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2864  phage head completion protein  26.85 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3046  phage head completion protein  26.85 
 
 		 154 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>